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Diese Studie zeigt, dass die Vitrifizierung neuraler Gewebe zu einer selektiven und strukturell kohärenten Unterrepräsentanz von Transkripten führt, die für membranintegrierte und sekretorische Proteine kodieren, wobei das Hippocampus-Gewebe anfälliger ist als der Kortex.
Die Studie zeigt, dass die DNA-Ligase-vermittelte MDA (DLMDA) zwar die DNA-Ausbeute aus FFPE-Proben erheblich steigert und globale Kopienzahlveränderungen bewahrt, jedoch die Sensitivität für das Detektieren spezifischer Amplifikationen und Deletionen verringert, was sie für Screening-Zwecke geeignet, aber für eine vollständige Analyse noch verbesserungsbedürftig macht.
Diese Studie untersucht die Langzeitstabilität von 44 RNA-Nukleosidstandards in wässriger Lösung bei verschiedenen Lagertemperaturen, identifiziert instabile Verbindungen und deren Abbauprodukte durch LC-MS-Analyse und quantenchemische Berechnungen, um praktische Richtlinien für die Lagerung und Qualitätskontrolle zur Verbesserung der Zuverlässigkeit von LC-MS-basierten RNA-Modifikationsanalysen zu etablieren.
Die Studie zeigt, dass epitranscriptomische Veränderungen, insbesondere eine erhöhte Uridin-Modifikation in pro-inflammatorischen Vaskulären glatten Muskelzellen, eine neue regulatorische Ebene für den Phänotyp-Übergang und die Atherosklerose-Progression darstellen.
Die Studie zeigt, dass sich die 2'-O-Methylierungsmuster von cytosolischen und ER-assoziierten Ribosomen in verschiedenen menschlichen Zelltypen kaum unterscheiden, was darauf hindeutet, dass diese Modifikation kein Hauptfaktor für die kompartimentspezifische Translation ist.
Die Studie zeigt, dass das Chromatin-modifizierende Enzym KDM2B über seine JmjC- und CxxC-Domänen die Expression und Aktivität von HIF-1 reguliert, wodurch es für die zelluläre Anpassung an Hypoxie und das Überleben unter Sauerstoffmangel entscheidend ist.
Diese Studie zeigt, dass sich die von Blattläusen zur Gallenbildung eingesetzten, sequenziell hochdivergenten Bicycle-Proteine strukturell auf saposin-ähnliche Faltungen zurückführen lassen, wobei die Analyse ihrer evolutionären Entwicklung auf eine Diversifizierung von disulfidverbrückten Vorläufern hindeutet, die es den Proteinen ermöglicht, verschiedene pflanzliche Zielstrukturen zu adressieren oder der Immunüberwachung zu entgehen.
Die Studie zeigt, dass der Zika-Virus die Wirtsepitranskriptom durch die Induktion alternativer Polyadenylierung neu gestaltet, was zur Entstehung neuer RNA-Isoformen führt, die bevorzugt von METTL3 methyliert werden und so eine koordinierte m6A-Remodellierung während der Infektion bewirken.
Die Studie zeigt, dass Barcode-Crosstalk bei der ONT-Multiplex-Sequenzierung, insbesondere bei geringen DNA-Eingaben, durch das alte Standardprotokoll stark auftritt, durch ein angepasstes ONT-Protokoll deutlich reduziert und durch ein hausinternes Protokoll mit Pooling nach Adapterligation nahezu vollständig eliminiert werden kann.
Die Studie zeigt, dass der Chromatin-Remodelling-Komplex NuRD für das „Enhancer-Resetting" als Reaktion auf ERK-Signale in Maus-ES-Zellen essenziell ist, indem er nach der Freisetzung der pausierten RNA-Polymerase II eine stabile Chromatin-Umgebung schafft, die einen schnellen und präzisen Austausch von Transkriptionsfaktoren ermöglicht.
Diese Studie erweitert und optimiert das auxin-induzierbare Degron-System AID2 für die Candida-Forschung, indem sie neue Vektoren für prototrophe Stämme, einschließlich klinischer Isolate und Candida auris, entwickelt, die CRISPR/Cas9-basierte Markierung und fluoreszierende Tags integriert sowie praktische Richtlinien für die Anwendung bereitstellt.
Die Studie stellt eine hochempfindliche, markierungsfreie Fluoreszenzdetektion des Proteins PDGF-BB mittels eines programmierbaren DNA-Logikgatters auf einer neuartigen 3D-gedruckten Hybrid-Papier-Polymer-Plattform vor, die zur Früherkennung von Präeklampsie bei schwangeren Frauen geeignet ist.
Diese Studie analysiert mittels Simulationen die konformationellen und molekularen Wechselwirkungen des SAM-I-Riboswitches mit seinem natürlichen Liganden SAM, dem inaktiven Analogen SAH und dem potenziellen Binder JS4, um die Mechanismen für die Entwicklung neuer RNA-basierter Antibiotika besser zu verstehen.
Vitamin D3 mildert die durch Stickstoffsenfgas verursachte Hauttoxizität, indem es über den intestinalen VDR-α-Defensin-Signalweg das Darmmikrobiom so umgestaltet, dass die abundance von Akkermansia muciniphila und die Butyratproduktion erhöht werden, was den Hautschaden verringert.
Die Studie identifiziert eine Mutation in der Schleifenstruktur des miR-3260-Vorläufers in *Bombyx mori*, die zwar mit einem durchsichtigen Larvenhäutchen assoziiert ist, aber keine messbaren Auswirkungen auf die Dicer-vermittelte Prozessierung oder die juvenile-Hormon-vermittelte Phänotypen zeigt.
Diese Studie identifiziert und charakterisiert neun Heavy Metal ATPase (VrHMA)-Gene im Mungbohnen-Genom, analysiert deren Struktur und cis-regulatorische Elemente sowie ihre gewebespezifische Expression unter Zink-, Cadmium- und Kupferstress, um ihre Rolle bei der Metallhomöostase und die Grundlage für die Züchtung stresstoleranter Sorten zu klären.
Diese Studie zeigt, dass Ribosomen-Pausen während der Translation nuclear kodierter Proteine in Arabidopsis thaliana gezielt auftreten, wenn Transitpeptide den Ribosomen-Austrittskanal verlassen, und dass diese Pausen für eine effiziente Zielsteuerung der Proteine in die Chloroplasten essenziell sind.
Die Studie zeigt, dass Ebola-Viren die Replikation und Transkription ihres Genoms durch die Umgestaltung des Wirtszellproteoms und die Aktivierung von Cyclin-abhängigen Kinasen (insbesondere CDK2) steuern, was diese Kinase-Familie als vielversprechende antivirale Zielstruktur identifiziert.
Diese Studie identifiziert funktionelle Parkinson-assoziierte regulatorische Varianten in menschlichen dopaminergen Neuronen, die durch die Modulation von Transkriptionsfaktor-Bindungsstellen die Expression der Gene SCARB2 und BAG3 beeinflussen und so neue mechanistische Einblicke in die Krankheitsentstehung liefern.
Diese Studie charakterisiert mittels Langread-RNA-Sequenzierung das mitochondriale Transkriptom des Zebrafischs und identifiziert eine neuartige, polyadenylierte lange nichtkodierende RNA namens lncOriL, deren ubiquitäre Expression und Regulation auch bei anderen Teleostern sowie beim Schwein und Menschen nachgewiesen wurde.